Uno de los objetivos del CENIEH es la implicación en la Educación, y en cumplimiento de este objetivo el Centro organiza activamente numerosas actividades.

• Dirección y supervisión de tesis doctorales y de másteres en universidades nacionales e internacionales.
• Estancias de investigación de doctorandos/as para la realización de sus tesis doctorales.
• Supervisión de estancias de personal investigador externo al Centro, en colaboración con las distintas áreas de investigación.
• Realización de prácticas vinculadas a los laboratorios del CENIEH.
• Impartición de clases de diversos másteres en colaboración la Universidad de Burgos y otras instituciones.
• Organización de training camps y distintos cursos de formación continua dirigidos al alumnado universitario, así como estudiantes de máster y de doctorado.