Manuel Rodríguez Almagro es graduado en Arqueología por la Universidad de Granada (2014-2018). Durante esos años participó en diferentes excavaciones en España e Italia como Galería de las Estatuas (Burgos), Cueva de la Malia (Guadalajara), Koskobilo (Navarra) y Pizzo Monaco (Sicilia), entre otras. Posteriormente realizó el máster en Cuaternario, Cambios Ambientales y Huella Humana en la Universidad del País Vasco/Euskal Herriko Unibertsitatea (2018-2019). Realizó su Trabajo Final de Máster sobre el estudio paleobiológico y tafonómico de la Cueva de Mainea (Navarra) bajo la supervisión de los Dr. Asier Gómez y Nohemi Sala.

Ha sido miembro del equipo que ha estudiado los restos de Koskobilo y de la Cueva de Mainea. Actualmente es miembro de los proyectos de excavación e investigación en el karst de Tamajón (Guadalajara), así como del equipo de investigación que estudia los yacimientos de Polvorín-Sima I (Karrantza, Bizkaia) y Baio (Zestoa, Gipuzkoa). Desde octubre de 2021 se encuentra realizando su tesis doctoral en el Centro Nacional de Investigación sobre la Evolución Humana (CENIEH) de Burgos dentro del Proyecto ERC-2020-STG-DEATHREVOL, centrado en el análisis tafonómico de restos fósiles de faunas procedentes de yacimientos del Cuaternario de la península ibérica.